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電子發(fā)燒友網(wǎng)>可編程邏輯>FPGA/ASIC技術(shù)>Xilinx FPGA在基因組測(cè)序中的優(yōu)勢(shì)

Xilinx FPGA在基因組測(cè)序中的優(yōu)勢(shì)

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基因組測(cè)序的應(yīng)用領(lǐng)域有哪些

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2018-05-29 15:31:04

Xilinx DRAGEN加速器管線創(chuàng)吉尼斯紀(jì)錄

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2018-03-28 15:05:11

芯片設(shè)計(jì)FPGA優(yōu)勢(shì)是什么?

芯片設(shè)計(jì)FPGA優(yōu)勢(shì)是什么?基于FPGA的芯片設(shè)計(jì)方法及流程是怎樣的?
2021-05-10 07:06:05

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2021-12-20 07:04:48

【F3使用場(chǎng)景】F3經(jīng)典使用場(chǎng)景

對(duì)于更低功耗,更低成本,更低處理延時(shí),更多定制化等的需求,將會(huì)逐漸凸顯??墒荈3人工智能大規(guī)模商業(yè)部署(推理應(yīng)用),具備獨(dú)特的性能優(yōu)勢(shì)和廣闊的潛在空間不可小視。低延遲相比于F3(FPGA),GPU
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2021-07-29 08:31:55

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基因組CNV分析的策略是什么?

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除了利用aCGH和snp芯片來(lái)檢測(cè)CNV之外,也可以通過(guò)NGS數(shù)據(jù)來(lái)分析CNV, 比如全基因組和全外顯子測(cè)序。針對(duì)全基因組CNV的檢測(cè),還針對(duì)開(kāi)發(fā)了一種稱之為C...
2021-07-29 08:24:37

基于大數(shù)據(jù)的食品學(xué)精進(jìn)安全食品

通過(guò)先進(jìn)的學(xué)技術(shù)平臺(tái)和方法學(xué)用于食品安全和營(yíng)養(yǎng)學(xué)的前沿研究,以提高我們消費(fèi)者的福利、健康就足夠了。內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)教授張和平《乳酸菌人和動(dòng)物健康的應(yīng)用-基于微生物基因組學(xué)的研究》報(bào)告說(shuō),目前
2017-11-17 15:54:34

淺析基因傳感器

21世紀(jì)是生物學(xué)發(fā)展的時(shí)代,特別是生物科學(xué)與計(jì)算機(jī)科學(xué)經(jīng)融合產(chǎn)生的生物信息學(xué)將得到蓬勃的發(fā)展。事實(shí)上,從20世紀(jì)90年代初隨著人類基因組計(jì)劃的實(shí)施,生物信息學(xué)就已開(kāi)始形成。一般地講,生物信息學(xué)指的是
2019-07-09 06:04:58

阿里云MaxCompute攜手華大基因打造精準(zhǔn)醫(yī)療應(yīng)用云平臺(tái),十萬(wàn)基因組計(jì)算成本降低至1000美金以內(nèi)

,每年我們會(huì)產(chǎn)生非常多的基因數(shù)據(jù),明年我們計(jì)劃對(duì)十萬(wàn)人進(jìn)行基因組基因測(cè)序和分析,我們將與阿里云計(jì)算平臺(tái)一起2018年用國(guó)產(chǎn)測(cè)序儀完成計(jì)算、分析和交付。識(shí)別以下二維碼,閱讀更多干貨
2018-03-19 10:50:19

神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)基因序列預(yù)測(cè)的應(yīng)用研究

人類基因組計(jì)劃的開(kāi)展隨之產(chǎn)生了巨量的基因組信息,區(qū)分DNA 序列上的外顯子和內(nèi)含子成為基因工程對(duì)基因進(jìn)行識(shí)別和鑒定關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一[1]。如何建立良好的系統(tǒng)模型將基因組數(shù)
2009-06-23 14:01:3226

什么是基因組序列數(shù)據(jù)庫(kù)

什么是基因組序列數(shù)據(jù)庫(kù) GSDB是基因組序列數(shù)據(jù)庫(kù)(Genome Sequence Data Base),由美國(guó)新墨西哥州Santa Fe的國(guó)家基因組資源中心創(chuàng)建。GSDB
2009-06-17 07:37:421681

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我國(guó)科研人員首次提出“人類泛基因組”概念 生意社12月9日訊 12月7日,國(guó)際著名科學(xué)期刊《自然》在其生物技術(shù)分刊《Nature Biotechnology》上發(fā)表了由深圳華大基因
2009-12-11 16:35:05991

基因芯片的工作原理及技術(shù)進(jìn)展與應(yīng)用

隨著人類基因組計(jì)劃( Human Genome Project)即全部核苷酸測(cè)序的即將完成,人類基因組研究的重心逐漸進(jìn)入后基因組時(shí)代( Postgenome Era)向基因的功能及基因的多樣性傾斜。通過(guò)對(duì)個(gè)體不同生長(zhǎng)發(fā)育階段或不同生理狀態(tài)下大量基因表達(dá)的平行分析,研究相應(yīng)基因
2011-01-20 14:31:014523

深圳華大基因研發(fā)出猴外顯子測(cè)序及分析平臺(tái)

深圳華大基因公布其已研發(fā)出猴外顯子測(cè)序及分析平臺(tái)。猴外顯子捕獲芯片和新一代高通量測(cè)序技術(shù)為該平臺(tái)的兩大核心技術(shù),使研究人員可以對(duì)每個(gè)猴基因組的所有外顯子進(jìn)行測(cè)序
2011-11-27 16:22:38815

中外基因組專家聯(lián)合研發(fā)新一代超級(jí)芯片

安捷倫科技公司和華大基因2月29日宣布,雙方將共同研究與開(kāi)發(fā)新一代的全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)方法。此次合作旨在基于安捷倫的SureSelect技術(shù)創(chuàng)建新一代“超級(jí)外顯子”捕獲芯片,這款
2012-03-02 08:57:431153

FPGA實(shí)時(shí)基因組測(cè)序計(jì)算大顯身手,把測(cè)序時(shí)間從30小時(shí)縮短到26分鐘!

基因組測(cè)序是一種新型基因檢測(cè)技術(shù),它可以從血液或者唾液中分析測(cè)定基因全序列,用來(lái)預(yù)測(cè)疾病,個(gè)人的行為特征等等。實(shí)現(xiàn)這一項(xiàng)技術(shù)需要海量的計(jì)算支持,常常需要等待一段時(shí)間才可以獲得檢測(cè)結(jié)果。然而
2017-02-08 09:12:11451

GUIDE-seq和Digenome-seq等全基因組CRISPR 檢測(cè)的關(guān)鍵技術(shù)介紹

/Cas9 存在嚴(yán)重的脫靶性,即該技術(shù)可以發(fā)生非特異性切割,引起基因組非靶向位點(diǎn)的突變,這樣會(huì)造成研究結(jié)果的不確定性以及研究工作的大量增加,這一問(wèn)題嚴(yán)重地限制了 Cas9 的應(yīng)用。 因此科學(xué)家們希望能通過(guò)全基因組檢測(cè)脫靶剪切,近年來(lái)研發(fā)了不少檢測(cè)脫靶剪切酶活性的實(shí)
2017-09-24 10:49:3124

基因檢測(cè)包含的技術(shù)及其中基因測(cè)序技術(shù)NGS的應(yīng)用現(xiàn)狀

測(cè)序)等。PCR、FISH 和芯片技術(shù),主要是通過(guò)已知序列去調(diào)查特定確定的片段序列或位點(diǎn)的有或無(wú),重點(diǎn)在檢,而基因測(cè)序技術(shù)是把基因序列上的核苷酸一個(gè)一個(gè)的測(cè)出來(lái),重點(diǎn)在測(cè)。目前應(yīng)用最廣的是二代測(cè)序,即 NGS。 測(cè)序應(yīng)用的分類 (一)非人類基因組應(yīng)用包括:科學(xué)研究
2017-09-27 09:25:548

谷歌新人工智能工具可準(zhǔn)確構(gòu)建人類基因組圖像并可應(yīng)用醫(yī)學(xué)方面

2017年12月,谷歌發(fā)布了一款新的人工智能工具,可利用基因測(cè)序數(shù)據(jù)準(zhǔn)確地構(gòu)建人類的基因組圖像。雖然科學(xué)家約十五年前就已經(jīng)首次完成人類基因組測(cè)序工作,但在十五年后的今天,理解編碼人類生命的海量
2017-12-19 13:17:002639

基于Xilinx 28nmFPGA的Dragen加速器板卡用于基因組分析算法的加速的解析

方案可能就不能夠滿足需求了,此外開(kāi)發(fā)一個(gè)ASIC處理器也需要較長(zhǎng)的時(shí)間周期。因此Edico Genome公司將注意力轉(zhuǎn)移到FPGA上,FPGA的靈活性非常適合這種不斷迭代開(kāi)發(fā)的需要,隨后該公司推出了基于Xilinx 28nm FPGA的Dragen加速器板卡用于基因組分析算法的加速。
2017-12-31 23:14:495926

高通量測(cè)序常用名詞匯總

高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次革命性的改變,一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定,因此在有些文獻(xiàn)稱其為下一代測(cè)序技術(shù)足見(jiàn)其劃時(shí)代的改變,同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能。
2018-02-28 14:05:554564

高通量測(cè)序生物信息學(xué)分析

高通量測(cè)序技術(shù)產(chǎn)生的DNA序列數(shù)據(jù)長(zhǎng)度較短,而且數(shù)據(jù)量非常巨大。分析了高通量測(cè)序環(huán)境下大數(shù)據(jù)的挑戰(zhàn)和機(jī)遇,總結(jié)并討論了數(shù)據(jù)壓縮、宏基因組數(shù)據(jù)序列拼接、宏基因組數(shù)據(jù)序列分析方面的算法和工具等研究成果。
2018-02-28 14:43:0717806

高通量基因測(cè)序是什么_高通量測(cè)序的意義

“普通的基因測(cè)序”應(yīng)該是指“常規(guī)DNA測(cè)序”吧,是用Sanger法進(jìn)行測(cè)序的方法。高通量測(cè)序的概念其實(shí)是一個(gè)相對(duì)的概念,2000年的時(shí)候,3700、MegaBace等儀器上的測(cè)序也是高通量測(cè)序,是相對(duì)手工測(cè)序或者跑平板膠來(lái)說(shuō)的。
2018-02-28 15:49:2541311

GeneData對(duì)基因組隱私保護(hù)研究進(jìn)度有重大突破

基因檢測(cè)是近年來(lái)生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域最受關(guān)注的前沿技術(shù)之一,它能夠?yàn)榛颊叽蛟旄_、更具針對(duì)性的治療方案。我們知道,基因往往存儲(chǔ)著一個(gè)人最深層次的隱私,但想要研究基因組就意味著不能完全限制它的使用,所以
2018-07-06 13:50:001768

晶相深耕安防監(jiān)控市場(chǎng) 搶攻基因測(cè)序芯片

晶相董事長(zhǎng)暨總經(jīng)理何新平表示,晶相主攻技術(shù)門(mén)檻高的高階市場(chǎng),安防監(jiān)控、基因測(cè)序檢測(cè)兩大領(lǐng)域皆與市場(chǎng)龍頭客戶攜手合作,預(yù)計(jì)今年安防相關(guān)業(yè)務(wù)持續(xù)成長(zhǎng),基因測(cè)序芯片則于6月正式量產(chǎn)出貨,高階工業(yè)用傳感器與基因測(cè)序芯片將成為未來(lái)獲利成長(zhǎng)主要?jiǎng)幽堋?/div>
2018-06-25 11:51:424276

影像傳感器廠商晶相強(qiáng)攻基因測(cè)序檢測(cè)市場(chǎng)

全球第三大影像傳感器廠商晶相(3530)即將于7月旬掛牌上市,晶相主力產(chǎn)品應(yīng)用在安防監(jiān)控、行車紀(jì)錄器,近期并強(qiáng)攻基因測(cè)序檢測(cè)市場(chǎng),晶相董事長(zhǎng)暨總經(jīng)理何新平表示,晶相主攻技術(shù)門(mén)檻高的高階市場(chǎng),安防
2018-06-26 09:03:001534

華為云攜手峰科發(fā)布FPGA基因加速云解決方案,基因測(cè)序性能提升5倍

為了更好的解決基因測(cè)序行業(yè)面臨的基因組分析標(biāo)準(zhǔn)流程不經(jīng)濟(jì)高效,以及跨不同云和硬件(CPUs,FPGAs)加速實(shí)現(xiàn)的雙重挑戰(zhàn)。華為云和峰科計(jì)算強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合,合作推出符合行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的GATK加速流程,通過(guò)對(duì)基因測(cè)序數(shù)據(jù)分析流程進(jìn)行軟、硬件聯(lián)合優(yōu)化實(shí)現(xiàn)端到端加速。
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材料基因組方法如何促進(jìn)鋰電池材料研發(fā)

“材料基因組計(jì)劃”的提出,為鋰電池新材料的開(kāi)發(fā)提供新的思路。“材料基因組”科學(xué)研究的關(guān)鍵是實(shí)現(xiàn)材料研發(fā)的“高通量”,即并發(fā)式完成“一批”而非“一個(gè)”材料樣品的。
2018-07-11 09:57:384841

區(qū)塊鏈對(duì)基因組數(shù)據(jù)的保護(hù)

我相信,我是唯一有權(quán)擁有關(guān)于我的基因組信息的人,就像我有表達(dá)想法的權(quán)利,選擇工作或宗教的權(quán)利。
2018-07-16 09:12:001053

基因測(cè)序龍頭:華大基因持續(xù)加大研發(fā)投入,授權(quán)專利多達(dá)282項(xiàng)

2017年7月份,華大基因正式掛牌,成為深交所第2001家上市公司,是實(shí)至名歸的基因測(cè)序龍頭企業(yè),也是具有全球品牌影響力的中國(guó)生命科學(xué)企業(yè)代表。
2018-07-24 10:09:124925

可以破壞乙肝病毒基因組的藥物研制成功,為乙肝患者帶來(lái)活著的希望

據(jù)消息稱,俄科學(xué)家研制出可以破壞乙型肝炎(簡(jiǎn)稱“乙肝”)病毒基因組的藥物,而且該藥物可能在6年后上市。
2018-08-08 15:42:333097

全國(guó)首個(gè)“城區(qū)全民基因組測(cè)序項(xiàng)目”深圳啟動(dòng),基因科技進(jìn)入臨床應(yīng)用

  近日,美國(guó)蓋辛格醫(yī)院集團(tuán)、羅湖醫(yī)院集團(tuán)和深圳市瀚海基因公司,三方共同在賓夕法尼亞州丹維爾市簽署戰(zhàn)略合作協(xié)議。羅湖醫(yī)院集團(tuán)和瀚海基因公司將聯(lián)合引進(jìn)蓋辛格醫(yī)院的MyCode(“我的代碼”)項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),啟動(dòng)全國(guó)首個(gè)“城區(qū)全民基因組測(cè)序項(xiàng)目”。
2018-08-28 11:28:414164

你去將你的基因組測(cè)序了嗎?面臨挑戰(zhàn)的基因組數(shù)據(jù)壓縮技術(shù)

,幅度遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)了存儲(chǔ)硬件價(jià)格的下降。未來(lái)五年內(nèi),存儲(chǔ)數(shù)十億人、動(dòng)物、植物和微生物的基因組的成本將輕松達(dá)到每年數(shù)十億美元。這些數(shù)據(jù)需要保存幾十年,甚至更長(zhǎng)時(shí)間。
2018-09-10 10:40:465216

FPGA能在實(shí)時(shí)基因組測(cè)序計(jì)算中大顯身手,大大縮短時(shí)間

目前,FPGA實(shí)時(shí)基因組測(cè)序計(jì)算大顯身手,把測(cè)序時(shí)間從30小時(shí)縮短到26分鐘,之后基因組測(cè)序計(jì)算時(shí)間將會(huì)縮短到10分鐘,預(yù)計(jì)一個(gè)全序列基因編譯可以接近實(shí)時(shí)的時(shí)間內(nèi)完成。
2018-10-09 16:51:352358

基因組醫(yī)學(xué)中區(qū)塊鏈出現(xiàn)的原因解析

基因組醫(yī)學(xué)打開(kāi)了遺傳數(shù)據(jù)的世界,提供了準(zhǔn)確的診斷,預(yù)后和適當(dāng)?shù)闹委?。利?b class="flag-6" style="color: red">基因組技術(shù),一個(gè)人的遺傳信息被可以剖析,以確定他們對(duì)疾病的易感性和適當(dāng)?shù)闹委煼桨?,為他們提供個(gè)性化的醫(yī)療。然而,遺傳數(shù)據(jù)的增加也帶來(lái)了一些問(wèn)題,包括數(shù)據(jù)訪問(wèn)、安全和隱私。這就是區(qū)塊鏈出現(xiàn)的原因。
2018-10-24 10:24:07956

基因檢測(cè)市場(chǎng)呈井噴式發(fā)展,產(chǎn)業(yè)整合將成為未來(lái)的必然趨勢(shì)

最近,深圳華大基因研究院運(yùn)用“無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)”技術(shù),搜集了超過(guò)十四萬(wàn)名中國(guó)孕婦的部分基因組樣本。本次研究涉及到的測(cè)序對(duì)象約占中國(guó)總?cè)丝诘娜f(wàn)分之一,其中還覆蓋了除漢族外的其他36個(gè)少數(shù)民族,這是迄今為止最大規(guī)模的中國(guó)人基因組測(cè)序和分析,對(duì)揭示基因與生育的聯(lián)系以及了解中國(guó)人口的基因結(jié)構(gòu)大有助益。
2018-10-28 09:57:106363

Clay Breshears博士討論基因組測(cè)序和生物信息學(xué)

英特爾?黑帶軟件開(kāi)發(fā)人員Clay Breshears博士討論了他目前如何在英特爾?健康與生命科學(xué)小組中使用基因組測(cè)序和生物信息學(xué)。
2018-11-07 06:07:003217

區(qū)塊鏈基因組數(shù)據(jù)Shivom生態(tài)系統(tǒng)介紹

幾十年來(lái),人類基因組一直是備受關(guān)注的科學(xué)研究主題。自2003年首次全面測(cè)序以來(lái),許多公司已經(jīng)開(kāi)始試行“個(gè)性化醫(yī)療”測(cè)試,這可能意味著藥物可以針對(duì)每個(gè)人的需求來(lái)量身定制。為了進(jìn)一步試驗(yàn)定制藥物,科學(xué)家們非常希望獲得基因組數(shù)據(jù)。
2018-12-17 14:40:231564

基因鏈究竟能為消費(fèi)者做些什么

信用卡號(hào)碼、駕照號(hào)碼和護(hù)照號(hào)碼是公民最有價(jià)值的身份證件。但更有價(jià)值的是我們出生時(shí)的數(shù)據(jù);我們的基因數(shù)據(jù)。基因組數(shù)據(jù)是指生物體的基因組和DNA數(shù)據(jù)。它們?cè)谏镄畔W(xué)中用于收集、存儲(chǔ)和處理生物基因組。
2019-02-15 11:35:513813

如何同時(shí)使用Nucleus與TensorFlow解決基因組學(xué)領(lǐng)域的機(jī)器學(xué)習(xí)問(wèn)題

本文中闡述的兩種方法均使用深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),學(xué)習(xí)將輸入映射至輸出的函數(shù)。神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)由若干層線性與非線性運(yùn)算構(gòu)成,而這些運(yùn)算會(huì)依次應(yīng)用至輸入。神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)已成功應(yīng)用于包括圖像分類和自然語(yǔ)言翻譯在內(nèi)的多個(gè)問(wèn)題領(lǐng)域。最近,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)也被用于解決基因組學(xué)問(wèn)題,例如蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和變異檢測(cè)。
2019-02-20 14:38:324466

區(qū)塊鏈技術(shù)正在推動(dòng)基因組數(shù)據(jù)行業(yè)的發(fā)展

為了確定區(qū)塊鏈技術(shù)可以對(duì)特定的行業(yè)產(chǎn)生什么樣的影響,找出對(duì)該技術(shù)存在什么樣的需求是很重要的。在這種情況下,需求的意義非凡。根據(jù)研究和市場(chǎng)公司發(fā)表的一份報(bào)告,到2022年,全球基因組行業(yè)的總市場(chǎng)規(guī)模預(yù)計(jì)將達(dá)到約240億美元。2017年,該行業(yè)的收入略低于150億美元。
2019-05-24 11:44:30904

國(guó)產(chǎn)芯片助力全球首次實(shí)現(xiàn)手機(jī)個(gè)人全基因組測(cè)序分析

在手機(jī)上也能進(jìn)行全基因組測(cè)序分析?沒(méi)錯(cuò)!據(jù)麥姆斯咨詢報(bào)道,近日,生命大數(shù)據(jù)高峰論壇暨第四屆基因組云計(jì)算技術(shù)開(kāi)發(fā)者峰會(huì)(GCTA 4),貴州貴陽(yáng)新世界(7.140, -0.03, -0.42%)酒店隆重舉行。華大基因(61.330, 0.33, 0.54%)會(huì)上正式發(fā)布了該黑科技。
2019-05-30 14:54:433359

國(guó)產(chǎn)芯片助力全球首次實(shí)現(xiàn)手機(jī)個(gè)人全基因組測(cè)序分析

在手機(jī)上也能進(jìn)行全基因組測(cè)序分析?沒(méi)錯(cuò)!近日,生命大數(shù)據(jù)高峰論壇暨第四屆基因組云計(jì)算技術(shù)開(kāi)發(fā)者峰會(huì)(GCTA 4)貴州貴陽(yáng)新世界酒店隆重舉行。華大基因在會(huì)上正式發(fā)布了該黑科技。
2019-06-05 15:08:174475

華大發(fā)布高精度基因組標(biāo)準(zhǔn)及解決方案 開(kāi)啟基因組測(cè)序“全高清”時(shí)代

基因組測(cè)序“全高清”時(shí)代!
2019-06-19 15:10:173736

關(guān)于基因組分析的優(yōu)勢(shì)和特點(diǎn)

臨床應(yīng)用環(huán)境,基因組學(xué)主要用于治療癌癥和遺傳性疾病。這些患者從疾病發(fā)作到發(fā)現(xiàn)原因或治療方法需要經(jīng)歷一個(gè)漫長(zhǎng)而曲折的旅程。早期進(jìn)行基因組測(cè)序可以幫助加速分析,從而縮短該旅程,消除大量的猜測(cè)和不必要或無(wú)效的過(guò)程,因?yàn)榇蠹s 80% 的罕見(jiàn)病癥都有遺傳起源。
2019-09-10 10:12:035386

通過(guò)材料基因組學(xué)來(lái)探索鋰電池相關(guān)材料的應(yīng)用

目前,材料科學(xué)的發(fā)展趨勢(shì)是基于實(shí)驗(yàn)和計(jì)算的大數(shù)據(jù)進(jìn)行的機(jī)器學(xué)習(xí)和深度分析,所謂的進(jìn)入密集大數(shù)據(jù)與人工智能相結(jié)合的新研究范式。材料基因組的方向也應(yīng)運(yùn)而生,關(guān)鍵技術(shù)在于構(gòu)建高通量的材料制備、高通量材料
2020-08-03 15:37:581405

利用基因組學(xué)和人工智能延年益壽將在未來(lái)可期

近日,據(jù)外媒報(bào)道,抗衰老產(chǎn)業(yè)價(jià)值1100億美元,到2025年估計(jì)會(huì)達(dá)到6100億美元,全球科學(xué)家正在利用基因組學(xué)和人工智能的力量來(lái)延年益壽。
2019-12-26 11:33:392758

華為云基因具備什么優(yōu)勢(shì)特點(diǎn)

未來(lái)生物技術(shù)發(fā)展與云計(jì)算的共同推動(dòng)下,基因測(cè)序“黑科技”必然會(huì)造福更多的人類。
2019-12-28 09:28:032519

AI加速推動(dòng)醫(yī)療個(gè)體化轉(zhuǎn)型 基因組學(xué)將有望成為未來(lái)發(fā)展主流

自2003年首次對(duì)人類基因組進(jìn)行測(cè)序以來(lái),整個(gè)基因組測(cè)序流程的成本就一直在下降,而且下降的速度遠(yuǎn)快于根據(jù)摩爾定律所預(yù)測(cè)的速度。從新生兒基因組測(cè)序到開(kāi)展全國(guó)人口基因組計(jì)劃,該領(lǐng)域正在蓬勃發(fā)展,并且日趨個(gè)體化。
2020-01-02 10:41:461215

英特爾、聯(lián)想和華大基因攜手分析新冠病毒基因組

英特爾和聯(lián)想攜手為華大基因提供的技術(shù)包括一個(gè)大型高性能計(jì)算集群,可用于處理從華大DNBSEQ-T7 測(cè)序系統(tǒng)讀取的高通量數(shù)據(jù)。
2020-03-03 14:01:012119

Intel、聯(lián)想以及華大基因宣布將共同推進(jìn)新型冠狀病毒基因組特性分析

今日,Intel、聯(lián)想以及華大基因今天宣布,三家公司正攜手加快COVID-19新型冠狀病毒的基因組特性分析。
2020-03-04 09:16:372978

NVIDIA的GPU加速將有望突破基因測(cè)序分析的瓶頸

NVIDIA的深度學(xué)習(xí)和加速計(jì)算技術(shù)的幫助下,基因組學(xué)將有望成為主流。
2020-03-21 09:47:221122

人工智能加速計(jì)算推動(dòng)醫(yī)療個(gè)體化的轉(zhuǎn)型

自2003年首次對(duì)人類基因組進(jìn)行測(cè)序以來(lái),整個(gè)基因組測(cè)序流程的成本就一直在下降,而且下降的速度遠(yuǎn)快于根據(jù)摩爾定律所預(yù)測(cè)的速度。
2020-03-24 09:15:42667

為什么基因組是決定一個(gè)人特征的獨(dú)特遺傳密碼

研究一個(gè)人或一群人的整個(gè)遺傳密碼可以幫助我們更好地了解疾病,并通過(guò)啟用精確醫(yī)學(xué)和強(qiáng)大的藥物基因組學(xué),研究基因如何影響人體對(duì)藥物的反應(yīng)。
2020-06-10 15:46:203521

便攜式芯片用于精密醫(yī)學(xué)及低成本基因組的測(cè)試

Roswell Biotechnologies正在與比利時(shí)微電子中心(Imec)合作,將于2021年制造首批商業(yè)化的分子電子生物傳感器芯片。這種芯片能用在便攜式或手持設(shè)備上以檢測(cè)新冠肺炎(COVID-19)和其他疾病,并能用于精密醫(yī)學(xué)及低成本基因組測(cè)序
2020-06-10 16:11:392425

披荊斬棘,乘風(fēng)破浪——真邁生物高通量基因測(cè)序儀GenoLab發(fā)布

自2005年首款高通量基因測(cè)序儀上市以來(lái),基因測(cè)序平臺(tái)便成為了全產(chǎn)業(yè)鏈規(guī)模最大、技術(shù)門(mén)檻最高、最關(guān)鍵的環(huán)節(jié)。隨著醫(yī)療健康行業(yè)對(duì)基因測(cè)序設(shè)備需求的持續(xù)增長(zhǎng),基因測(cè)序技術(shù)正成為核心技術(shù)。
2020-10-21 16:54:302901

科學(xué)家研發(fā)加快DNA測(cè)序進(jìn)程的軟件

據(jù)外媒報(bào)道,約翰·霍普金斯大學(xué)的研究人員稱,一種全新的開(kāi)源軟件可以從根本上加快DNA測(cè)序的進(jìn)程。據(jù)悉,這個(gè)叫做UNCALLED的軟件通過(guò)使用便攜式測(cè)序器可以將原先15天的操作時(shí)間縮短到3天乃至1天。全基因組測(cè)序是一個(gè)漫長(zhǎng)而痛苦的過(guò)程--并且很多時(shí)候,研究人員可能只對(duì)基因組的特定部分感興趣。
2020-12-16 15:47:181915

國(guó)產(chǎn)納米孔基因測(cè)序成都面世

眾所周知,基因測(cè)序技術(shù)能鎖定病變基因,從而對(duì)相關(guān)病癥做到提前預(yù)防和診治。今年新型冠狀病毒疫情爆發(fā)期間,基因測(cè)序技術(shù)就在病毒株的分析、溯源中發(fā)揮了舉足輕重的作用。
2021-03-27 09:51:20886

成都高新區(qū)企業(yè)生產(chǎn)的納米孔基因測(cè)序儀正式面世

基因測(cè)序儀是測(cè)定DNA片段的堿基順序、種類和定量的儀器,主要應(yīng)用在人類基因組測(cè)序、人類遺傳病、傳染病和癌癥的基因診斷等方面。 近日,記者從成都高新區(qū)獲悉,成都高新區(qū)企業(yè)生產(chǎn)的一款納米孔基因測(cè)序
2021-01-19 10:05:262176

貝瑞基因:提前布局占據(jù)高點(diǎn),積極推進(jìn)三代測(cè)序臨床

凱瑟琳·伍德專注于識(shí)別那些被誤解和被忽視的股票,她認(rèn)為DNA測(cè)序、機(jī)器人技術(shù)、能源儲(chǔ)存、人工智能和區(qū)塊鏈這五大科技創(chuàng)新將顛覆全球經(jīng)濟(jì),她曾表示,“目前市場(chǎng)上定價(jià)最被低估的領(lǐng)域是基因組學(xué)?!?/div>
2021-03-01 14:38:112589

“解碼”單細(xì)胞測(cè)序的故事

有別于傳統(tǒng)的基因芯片,從超過(guò)混合數(shù)萬(wàn)個(gè)細(xì)胞中提取的DNA或者RNA進(jìn)行測(cè)序,得出平均值。單細(xì)胞測(cè)序可以單個(gè)細(xì)胞層面解析基因組及其表達(dá)調(diào)控特征,能更全面掌握細(xì)胞的功能。
2021-03-17 11:02:102803

基于異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)層次的基因節(jié)點(diǎn)表示學(xué)習(xí)方法

基因組測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展使得生物數(shù)據(jù)庫(kù)基因基因組序列數(shù)據(jù)數(shù)量迅速增加,但其中仍有大量基因功能是未知的。為此,提出基于異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)層次注意力機(jī)制的基因節(jié)點(diǎn)表示學(xué)習(xí)方法HAGE,用以預(yù)測(cè)基因功能。結(jié)合
2021-03-26 16:15:065

基于計(jì)算分析的高可用彈性宏基因組學(xué)計(jì)算平臺(tái)

復(fù)雜度測(cè)序數(shù)據(jù),讓研究人員處理過(guò)程面臨諸多困難面,大規(guī)模測(cè)序數(shù)據(jù)的分析消耗資源,如硬件資源、時(shí)間成本等;另一方面,計(jì)算分析過(guò)程必然涉及到的大量宏基因組學(xué)計(jì)算分析工具很難由普通使用者自行部署、調(diào)試與維護(hù)。文中對(duì)比了領(lǐng)域內(nèi)主流的宏基因組學(xué)計(jì)算平臺(tái),
2021-04-19 10:54:156

Illumina將在五年內(nèi)捐贈(zèng)價(jià)值約6000萬(wàn)美元的高通量基因測(cè)序

“迅速識(shí)別疫情并對(duì)其傳播和演變進(jìn)行追蹤對(duì)全世界都有積極意義,對(duì)于加強(qiáng)醫(yī)療健康系統(tǒng)至關(guān)重要”,Illumina首席執(zhí)行官Francis deSouza表示:“基因組學(xué)能夠推動(dòng)各國(guó)公共衛(wèi)生體系應(yīng)對(duì)生物威脅方式上的革命性發(fā)展,而這一全球計(jì)劃將有助于使需要幫助的地區(qū)獲取測(cè)序技術(shù)和專業(yè)知識(shí)?!?/div>
2021-05-06 10:41:532424

應(yīng)用深度學(xué)習(xí)分析提高基因組分析的準(zhǔn)確性

的 Genomics 團(tuán)隊(duì)很高興分享我們對(duì) DeepVariant 的最新擴(kuò)展 - DeepTrio。 DeepVariant 于 2017 年首次發(fā)布,是一種開(kāi)源工具,支持研究人員和臨床醫(yī)生分析個(gè)人的基因組測(cè)序數(shù)據(jù)并
2021-05-14 09:49:472709

直線電機(jī)模組基因測(cè)序H5N6禽流感分析的作用

先進(jìn)的基因測(cè)序技術(shù),對(duì)病毒毒株進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)其與我國(guó)目前廣泛使用的H5亞型(Re-11+ Re-12)疫苗株高度同源(達(dá)到98.4%),表明現(xiàn)有疫苗具備對(duì)該病毒的預(yù)防效果。
2021-05-21 14:19:18880

直線電機(jī)模組被引入基因測(cè)序設(shè)備

那么,對(duì)新型冠狀病毒進(jìn)行基因測(cè)序的目的和好處是什么呢?據(jù)悉,通過(guò)基因測(cè)序可以動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)新型冠狀病毒的變異情況,為后續(xù)研究病毒變異對(duì)病原檢測(cè)和疫苗保護(hù)效果影響、調(diào)整防控政策等提供科學(xué)的依據(jù)。
2021-06-07 15:27:57698

NGS技術(shù)發(fā)展現(xiàn)狀及應(yīng)用情況如何?

第一個(gè)全基因組測(cè)序圖譜。 針對(duì)個(gè)人的基因組測(cè)序服務(wù)剛出現(xiàn)時(shí),測(cè)序費(fèi)用高達(dá)上百萬(wàn)美元,普通人望塵莫及?,F(xiàn)今,做個(gè)全基因組測(cè)序帶分析,一個(gè)實(shí)驗(yàn)員+一個(gè)生信員(生物信息分析員)兩周就可以出結(jié)果,價(jià)格1000美元左右。 曾經(jīng)要聯(lián)合各國(guó)
2021-06-22 16:56:516377

北鯤云超算平臺(tái)解決基因測(cè)序困境

人體細(xì)胞內(nèi)的DNA組成了基因,而變化莫測(cè)的基因排序決定了生物遺傳變異的特性。在生命科學(xué)領(lǐng)域的基礎(chǔ)性研究就是人類基因組的研究,基因組圖譜是研究人員的“新華詞典”。任何時(shí)候,破解人類自身的基因密碼才能夠更好地開(kāi)發(fā)促進(jìn)人類健康,預(yù)防疾病的醫(yī)療方法,其應(yīng)用前景是廣闊的,能夠帶來(lái)的未來(lái)是美好的。
2021-07-24 13:15:22838

這家企業(yè)推出的三代基因測(cè)序產(chǎn)品或與直線電機(jī)模組有關(guān)

水,一次破局,未來(lái)貝瑞基因將在對(duì)三代基因測(cè)序產(chǎn)品的不斷驗(yàn)證,讓三代基因測(cè)序產(chǎn)品得到優(yōu)化,而未來(lái),大家會(huì)清晰地知道,三代測(cè)序產(chǎn)品和二代測(cè)序產(chǎn)品相對(duì)互補(bǔ),三代測(cè)序可以解決很多二代測(cè)序做不到的問(wèn)題,比如一些結(jié)構(gòu)特殊、位
2021-09-02 09:29:38847

北鯤云超算平臺(tái)對(duì)于基因組學(xué)研究能夠提供哪些幫助?

隨著眾多生物基因組測(cè)序項(xiàng)目的完成,生物學(xué)數(shù)據(jù)正在加速度增長(zhǎng)。從高通量/多組學(xué),到單分子/單細(xì)胞;從多倍體/單倍型到宏基因組/環(huán)境基因組;從精準(zhǔn)醫(yī)療到系統(tǒng)醫(yī)學(xué)等等,后基因組時(shí)代的基因組技術(shù)正在顛覆傳統(tǒng)
2021-11-15 14:24:21755

NVIDIA Clara Parabricks助力基因組學(xué)和藥物研究

世界上最大的遺傳學(xué)研究鑒定數(shù)據(jù)庫(kù)使科學(xué)家能夠訪問(wèn)NVIDIA Clara Parabricks,以加速推進(jìn)基因組學(xué)和藥物研發(fā)領(lǐng)域的發(fā)展。
2022-02-17 11:07:492196

微流控芯片技術(shù)單細(xì)胞基因組學(xué)研究的應(yīng)用

單細(xì)胞基因組學(xué)包括單細(xì)胞全基因組測(cè)序和以單細(xì)胞和微量細(xì)胞為材料的全基因組范圍內(nèi)的基因功能研究。功能基因組學(xué)以結(jié)構(gòu)基因組學(xué)所取得的靜態(tài)堿基序列信息為基礎(chǔ),基因組水平上,高通量大規(guī)模的動(dòng)態(tài)分析多種
2022-03-03 13:04:592912

Clara Parabricks 3.7可加速基因組的分析

種工具, Clara Parabricks 為臨床和研究工作流程基因面板、外顯子基因組提供準(zhǔn)確和加速的基因組分析。
2022-04-06 15:43:042155

將加速基因組分析擴(kuò)展到RNA 、基因面板和注釋

NVIDIA Clara Parabricks v3 的發(fā)布。 6 去年夏天,基因組和全外顯子測(cè)序分析綜合工具包 添加了多個(gè)加速體細(xì)胞變異調(diào)用者和用于注釋和質(zhì)量控制 VCF 文件的新工具。
2022-04-10 17:19:533612

直線電機(jī)模組單色熒光基因測(cè)序的應(yīng)用

千呼萬(wàn)喚始出來(lái),5月9日,由重慶銘毅智造科技有限公司自主研發(fā)的單色熒光高通量基因測(cè)序儀UniSeq2000TM終于揭開(kāi)神秘面紗,正式與公眾見(jiàn)面。
2022-05-18 08:12:321216

使用NVIDIA Clara Parabricks 3.8加速基因組分析

  與基于CPU的環(huán)境相比,最先進(jìn)的生物信息學(xué)工具的速度提高了60倍。全基因組工作流程的端到端分析只需22分鐘,外顯子工作流程只需4分鐘。大規(guī)模測(cè)序項(xiàng)目和其他全基因組研究能夠一臺(tái)DGX服務(wù)器上每天分析60多個(gè)基因組,同時(shí)降低相關(guān)成本,產(chǎn)生比以往任何時(shí)候都有用的見(jiàn)解。
2022-06-21 15:23:002159

數(shù)字化服務(wù)提供商榮聯(lián)與天津海關(guān)共建基因組數(shù)據(jù)庫(kù)及分析平臺(tái)

快速準(zhǔn)確的鑒定物種一直是基因組進(jìn)化和物種鑒別的一大挑戰(zhàn),海關(guān)口岸業(yè)務(wù),瀕危動(dòng)植物制成品形態(tài)多樣,物種鑒別困難,口岸生物安全防控形勢(shì)更加嚴(yán)峻,進(jìn)一步強(qiáng)化海關(guān)物種鑒定能力、提升基因信息分析效率成為
2022-06-24 12:24:111339

使用北鯤云AWS上運(yùn)行基因分析HPC任務(wù)

的應(yīng)用。 基因組學(xué)是這一趨勢(shì)的一個(gè)主要例子,其中高通量下一代測(cè)序 (NGS) 設(shè)備被用于對(duì) DNA、mRNA、調(diào)控區(qū)域、腸道微生物等進(jìn)行測(cè)序。計(jì)算工作流程也快速開(kāi)發(fā)和標(biāo)準(zhǔn)化,并且支持動(dòng)態(tài)進(jìn)行擴(kuò)展。隨著大量基因組數(shù)據(jù)的收集,處理時(shí)間通常在
2022-11-16 13:57:061068

基因測(cè)序的云計(jì)算解密

,需要借助高性能計(jì)算來(lái)處理海量爆炸的數(shù)據(jù)資源! 基因測(cè)序通常會(huì)面臨以下三個(gè)痛點(diǎn): 1 基因測(cè)序業(yè)務(wù)一般分為項(xiàng)目型,有波峰波谷的區(qū)別,為了足夠的資源支撐的同時(shí)不造成資源浪費(fèi),會(huì)選擇云計(jì)算彈性使用的資源。 2 復(fù)雜基因組
2022-11-28 15:46:541292

未來(lái),直線電機(jī)模組基因測(cè)序設(shè)備或?qū)?yīng)用于多方位測(cè)序場(chǎng)景

當(dāng)下,基因測(cè)序主要應(yīng)用于罕見(jiàn)病例的病因?qū)W診斷、流行病和常見(jiàn)病的預(yù)測(cè)診治、遺傳學(xué)當(dāng)中、癌癥研究當(dāng)中等,但未來(lái),其或?qū)?yīng)用于多方位測(cè)序場(chǎng)景。
2022-12-15 08:22:571069

百度智算峰會(huì)精彩回顧:GPU 加速藥物研發(fā)與基因組學(xué)分析

,“2022 百度云智峰會(huì)·智算峰會(huì)”成功舉辦。 NVIDIA 資深解決方案架構(gòu)師翟健 分享了以“ GPU 加速藥物研發(fā)與基因組學(xué)分析 ”為題的演講,介紹了 NVIDIA 如何利用 GPU 和加速軟件推動(dòng) AI 驅(qū)動(dòng)的藥物研發(fā)與基因組學(xué)分析,包括 NVIDIA 與百度智能云賦能藥物研
2022-12-29 00:00:051412

基因組學(xué)大型語(yǔ)言模型多項(xiàng)任務(wù)均展現(xiàn)出卓越的性能和應(yīng)用擴(kuò)展空間

InstaDeep、慕尼黑工業(yè)大學(xué)(TUM)和 NVIDIA 之間的合作推動(dòng)了面向基因組學(xué)的多超級(jí)計(jì)算規(guī)模的基礎(chǔ)模型開(kāi)發(fā)進(jìn)程。這些模型大量預(yù)測(cè)任務(wù)(例如啟動(dòng)子和增強(qiáng)子位點(diǎn)預(yù)測(cè))展示了最先進(jìn)的性能
2023-01-17 01:05:041217

【百萬(wàn)倍加速】加速計(jì)算助力基因測(cè)序突破極限

”—基因組被科學(xué)家破解以來(lái),人類追求速度更快、成本更低的基因測(cè)序技術(shù)的腳步一直都在繼續(xù)。 1 月 13 日剛剛結(jié)束的摩根大通醫(yī)療健康大會(huì)上,NVIDIA 發(fā)布了與初創(chuàng)公司 InstaDeep、慕尼黑工業(yè)大學(xué)(TUM)基因組學(xué)大型語(yǔ)言模型方面的聯(lián)合研究成果。
2023-02-02 11:35:031105

人工智能如何改變基因組學(xué)?

人進(jìn)行測(cè)序,還是大規(guī)模人群的遺傳學(xué)研究,全基因組測(cè)序正在成為臨床工作流程和藥物研發(fā)的重要一環(huán)。 但基因組測(cè)序只是第一步。基因組測(cè)序數(shù)據(jù)分析需要通過(guò)加速計(jì)算、數(shù)據(jù)科學(xué)和 AI 來(lái)讀取和理解基因組。隨著摩爾定律(集成電路
2023-04-05 00:25:031255

GPU助力基因組測(cè)序分析

等。隨著近幾年基因測(cè)序成本如圖 1所示不斷下降,萬(wàn)元內(nèi)即可完成人類的全基因組測(cè)序,GPU的技術(shù)發(fā)展也帶來(lái)分析成本與時(shí)間的下降,于是用于檢測(cè)基因組變化的重測(cè)序技術(shù)癌癥治療起到了越來(lái)越重要的作用。基因組測(cè)序的應(yīng)用主要有三個(gè)方向。
2023-08-01 10:32:444216

基于液滴微流控的亞硫酸鹽測(cè)序平臺(tái)研究

基因組DNA甲基化圖譜在整個(gè)表觀基因組圖譜具有重要意義。單細(xì)胞DNA甲基化學(xué)研究為根據(jù)甲基化學(xué)特征檢測(cè)和分析細(xì)胞亞群提供強(qiáng)大助力。
2023-08-17 09:11:141852

基于微流控的低成本空間轉(zhuǎn)錄測(cè)序方法

空間轉(zhuǎn)錄學(xué)技術(shù)是揭示組織精細(xì)解剖位置的學(xué)工具?;诟咄?b class="flag-6" style="color: red">測(cè)序的空間轉(zhuǎn)錄學(xué)技術(shù)具有檢測(cè)結(jié)果無(wú)偏移、使用門(mén)檻低等優(yōu)勢(shì)。
2023-08-24 09:08:302072

高通量測(cè)序技術(shù)及原理介紹

高通量測(cè)序技術(shù)是生物學(xué)領(lǐng)域中一種重要的分析工具,它可以快速、準(zhǔn)確地測(cè)定DNA序列或RNA序列。高通量測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn),極大地促進(jìn)了基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄學(xué)以及生物信息學(xué)等領(lǐng)域的發(fā)展。本文將從高通量測(cè)序技術(shù)
2024-02-03 14:46:0917835

中科曙光構(gòu)建全國(guó)產(chǎn)化基因組學(xué)高性能計(jì)算平臺(tái)

近日,中科曙光承建的國(guó)內(nèi)某研究所基因組學(xué)高性能計(jì)算平臺(tái)正式交付。這是國(guó)內(nèi)生物信息學(xué)領(lǐng)域首個(gè)從底層硬件到上層軟件實(shí)現(xiàn)完全自主可控,并深度融合高性能計(jì)算與人工智能算力的平臺(tái),成功填補(bǔ)了該領(lǐng)域國(guó)產(chǎn)高端算力的空白。
2025-06-26 17:36:39900

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