就一個R和SAS精通程度幾乎相同，在兩種環境下都做過比較大（moderately big， ~xx Gb）的數據分析，與其他語言環境嵌合（SQL， Perl， etc.。。），使用過的個人（統計專業人員，非編程專業人員）的感受而言如下：

R的優點：

1. 免費。。。 開源。。。 （這是最重要的一點好不好，也是SAS流行于公司，R流行于研究機構和大學的最主要原因）

2. 是專門為統計和數據分析開發的語言，各種功能和函數琳瑯滿目，其中成熟穩定的一抓一把

3. 語言簡單易學。雖與C語言之類的程序設計語言已差別很大（比如語言結構相對松散，使用變量前不需明確正式定義變量類型等等），但仍保留了程序設計語言的基礎邏輯與自然的語言風格。我這樣說可能讓人聽得云里霧里，但是如果你對SAS或者SPSS有一點點了解，就會明白我的意思了。。。

4. 小。。。 安裝程序只有50Mb左右，比起某些死貴且3個G的付費軟件真的是超級迷你小巧玲瓏。。。 因為體積輕便，運行起來系統負擔也小。

5. 同各種OS的兼容性好。我兩臺本本一臺Windows，一臺Linux，都用得很順手。相比之下，你有見過人在Mac上用SAS嗎。。。 這人是要多么的想不開。。。 =。 =

6. 因為用的人越來越多，又是開源，有很多配套的“插件”為其錦上添花。比如xtable里有一個函數可以直接將R里的表格導出為TeX格式；另有RStudio的插件讓你可以在同一個環境里寫TeX跑R并可在你的TeX文件中插入你的R代碼，多么的賢良淑德。。。 （這個插件我沒用過，不過我同學一天到晚在用）

7. 有R GUI和RStudio兩種風格供君選擇，說實話我覺得這兩種風格已經涵括了大多數人的使用偏好。。。

8. 已經提過了開源，還想再強調一下。各種包和函數的透明性極好，這使得對函數的調整和改良變得非常便利。只需要把源碼調出來，自己稍微修改一下就可以了。這種事情放在任何其他統計軟件里都近乎奢望。

9. 如果你做Bayesian，用R你有OpenBUGS， WinBUGS， JAGS等各種成熟活潑的包裹，很多語言又簡單又附帶各種預設的plot，你只需調用即可；還可以自己寫MCMC。如果你用SAS/SPSS/Stata，你可以。。。 @@？ = =bbb

10. 漂亮又靈活的圖，大家也都已經講過了。原本不是什么特別突出的長處（有則好，沒也沒啥），不過現在數據可視化越來越熱，也就一躍成為主要優點了。

缺點：

1. 對大文本（text data）處理極差。。。 或者說data management本就不是R的強項。SAS于R的最大優勢之一可能就在于它兼顧了數據分析和數據管理。在SAS里對數據進行各種復雜操作都相對容易，只需要簡單的DATA STEP（必要時結合PROC SQL）即可完成；在R里可就真的是千辛萬苦。。。 雖然也有相應的aggregate， merge之類的函數，但是大都不太好用。這也是為什么大家常常把數據（尤其是數據大時）在別的環境下整好/分割好再喂給R。人家術業有專攻，數據管理真是有些難為它了。

2. 內存管理和平行處理（parallel processing/programming）都為人詬病。數據小時沒有感覺，數據大了就各種報錯。。。 =。 =

3. package的可靠性問題。我第一門完全使用R做作業的課是門統計課，教授已經六十多歲，見過各種統計軟件的出生發展和湮沒。她同我們說到R時第一句話就是Never use a package before you understand the manual and confirm the validity of the functions. 也就是包裹雖然好，使用需謹慎。主要原因還是在于開源。不常用的package一定要搞清楚函數的用法和核實過輸出，不然真的不推薦使用。我個人也是傾向非常用函數盡量自己寫，至少錯了也容易debug.。。

4. 不得不提的package的版本問題。 就算你確認了包裹的可靠性并熟知了各個變量要怎么用，還是可能掉入潛在的陷阱=。 = 講個真事：去年工作的時候一個項目是使用11年某項目的一個貝葉斯模型分析新的數據。當年寫代碼的人因為相信末日說兩年前就已經辭職環游世界去了，于是我只好獨自研讀他的代碼。第一步，很自然的，就是重復當年的分析結果。這時發現當年他用的一個package和現在的R已經不兼容，于是就下載了這個package的最新版本。結果有一個簡單的credible interval怎么都重復不出來。。。 怎么怎么都重復不出來。。。 我都快絕望了。最后經各種推理驗證，發現這個區別源自于新舊版本的函數內部在對數據排序之后對NaN的不同處理。。。 而這個小小的修改未在任何地方留下任何文字記錄。所以怎么說呢。。。 很多時候還是寫自己的程序靠譜哇。。。

5. 當你跑比較大的simulation，對效率有要求的時候，有時還是不得不用C，這可能是10小時和10分鐘的差別，毫不夸張。