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?AI正在成為生命科學(xué)爆發(fā)與裂變的技術(shù)支點

hl5C_deeptechch ? 來源:DeepTech深科技 ? 作者:DeepTech深科技 ? 2020-12-25 09:37 ? 次閱讀
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12 月 10 日 - 11 日,由浙江省委人才辦、紹興市委市政府、《麻省理工科技評論》主辦的全球青年科技領(lǐng)袖峰會暨《麻省理工科技評論》中國 “35 歲以下科技創(chuàng)新 35 人” 頒獎典禮在紹興上虞舉行,“35 歲以下科技創(chuàng)新 35 人” 2020 年中國榜單正式發(fā)布。 會上, 晶泰科技聯(lián)合創(chuàng)始人兼 CEO 馬健發(fā)表了《AI 賦能新藥研發(fā)》的主題演講。 他認為,過去很多年,AI 藥物研發(fā)公司普遍分布在從機理研究、藥物設(shè)計乃至到臨床研究,現(xiàn)在正從局部優(yōu)化逐漸走向全局優(yōu)化,AI 將為新藥研發(fā)帶來一個全新的加速過程。在藥物研發(fā)領(lǐng)域,AI 技術(shù)的下一塊拼圖在于數(shù)據(jù),挖掘已有的數(shù)據(jù)很重要,但是更重要的是提高數(shù)據(jù)產(chǎn)生能力。 ????

他表示:“生命科學(xué)研究醫(yī)藥是與時間的賽跑,而人工智能就是下一個時代,生命科學(xué)爆發(fā)的一個外源動力?!? 根據(jù)《中國發(fā)展報告 2020》,2050年時中國將擁有 3.8 億 65 歲以上的人口,占國家總?cè)丝诒壤_到 27.9%,這樣老齡化的發(fā)展會給生物醫(yī)藥帶來非常大的需求。2018 年有一部電影叫《我不是藥神》,其描述了用藥難的問題。事實上,目前很多創(chuàng)新藥物未能滿足臨床需求。很多人說 2020 年是生物醫(yī)藥的元年,這是因為疫情給我們提出非常多的新命題。 如何在最短的時間內(nèi)跨過重重障礙開發(fā)出新的藥物來?對生命科學(xué)技術(shù)來說,生物醫(yī)藥研發(fā)不僅是商業(yè)行為和經(jīng)濟問題,也是很大的社會問題。

馬健介紹,過去這些年藥物研發(fā)的整體回報率在不斷下降,新藥物越來越難被發(fā)現(xiàn),越來越難被認可,同時還要面臨重重安全、有效等等關(guān)鍵指標(biāo)的挑戰(zhàn),有很多疾病到現(xiàn)在都沒有合適的藥物,還有很多疑難雜癥迄今尚無有效治療方法。 為什么這么難?藥物研發(fā)一般是從早期機理靶點發(fā)現(xiàn),然后到臨床前研究,再進入人體的臨床研究。其中面臨著 “三高一長” 的特性:高風(fēng)險、高投入、高回報、周期長?;诮y(tǒng)計數(shù)據(jù)來講,一款創(chuàng)新藥物從最早研究的發(fā)現(xiàn)階段開始走到臨床,需要十年和二十六億美金,不僅耗資巨大,而且時間非常漫長。 藥物分子設(shè)計就像千軍萬馬過獨木橋,從最開始大量的候選化合物,經(jīng)過層層遴選后,很多化合物最后失敗在藥物安全性和藥效上。真正能夠走到最后上市的藥物,其實 FDA 每年最多批準(zhǔn)三十幾個藥,但是全球藥物研發(fā)卻有大量的活動。

“藥物研發(fā)過程非常復(fù)雜,比如發(fā)現(xiàn)了一個疾病的致病基因,這個基因表達一個蛋白,蛋白就像一把鎖,這個鎖有一個鎖眼。藥物發(fā)現(xiàn)就相當(dāng)于找一把鑰匙,這把鑰匙正好能打開這把鎖,可以調(diào)控機理治療疾病。當(dāng)然,這是一種非常美好和形象的比方。在我們實際做研究和藥物發(fā)現(xiàn)的過程當(dāng)中,真實的感覺卻更像另一部電影《諜中諜》。有時候就像是一個看上去不可能完成的任務(wù)?!?馬健打了個比方。 即便科學(xué)家設(shè)計出了一把 “鑰匙”,它完成了最后一步在細胞內(nèi)蛋白層面的操作,但是新藥進入人體內(nèi),經(jīng)過器官、血液、吸收、穿透細胞膜,卻需要一個 “特工” 帶著這把鑰匙潛入敵人的大樓通過重重關(guān)卡,最終才能抵達病灶的終點。 所以,藥物的發(fā)現(xiàn)遠不是只設(shè)計一把” 鑰匙” 那么簡單,我們需要開發(fā)一個具備完善能力的分子才能夠有效去解決這樣的疾病。這個過程通常用物理和數(shù)學(xué)的方式層層進行篩選,從而多階段、多目標(biāo)地優(yōu)化問題,在面臨這樣問題的時候,我們自然會想到,是否有更多的源頭創(chuàng)新的技術(shù),能幫科學(xué)家們找到更多好的候選化合物,以及更好地優(yōu)化指標(biāo)并把藥物快速設(shè)計出來。 這便是 AI 技術(shù)過去幾年在醫(yī)藥研發(fā)領(lǐng)域越來越關(guān)鍵的原因,就像當(dāng)年 AlphaGo 在圍棋領(lǐng)域戰(zhàn)勝人類冠軍一樣,最近谷歌新推出的 AlphaFold 程序利用 AI 技術(shù)做蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測,其實很多新思想和新方法也會對行業(yè)上下游有更多啟示。

AI 在藥物研發(fā)中,很多時候扮演的角色是幫助科學(xué)家去廣泛探索化學(xué)空間,精確找到可以成藥的分子。 比如類藥的化合物空間是一個非常龐大的數(shù)字 ——10 的 60 次方,這么大的化學(xué)空間中這么多可能的分子當(dāng)中,要找到最后可能會治療疾病的藥物,人的智力可觸達的空間非常有限??茖W(xué)家需要從分子的產(chǎn)生和分子搜索,再到計算化學(xué)和物理手段把分子的活性和選擇性相關(guān)藥效的屬性描述出來,之后再通過自動化高通量的方法合成和測試完成這樣的過程,來加速藥物發(fā)現(xiàn)。 “晶泰科技過去幾年一直致力于做藥物創(chuàng)新和 AI 賦能,在我們的實際工作中,跟藥企的合作和孵化創(chuàng)新藥物的過程都經(jīng)過了這樣的過程,我們的工作更像是藥物研發(fā)專家手里的升級武器,一個思想的放大器,專家給我們一個 idea,我們通過 AI 技術(shù)可以給你一千個、一萬個或是在新范圍內(nèi)找到更好的 idea,這樣就能完成思想的跨越,打開想象的空間。” 馬健說道。 目前,通過 AI 和量子物理算法,晶泰科技可以實現(xiàn)對類藥化學(xué)空間的全局探索,在更廣闊的化學(xué)空間中尋找全新的藥物分子。同時,在 AI 的協(xié)同下,對于可成藥分子的毒性、選擇性等關(guān)鍵性質(zhì)進行綜合打分,快速收斂??梢詫l(fā)現(xiàn)先導(dǎo)化合物的速度從 12 個月提升到 3 個月,藥物發(fā)現(xiàn)的合成分子數(shù)量從上千降到 200 以內(nèi)。其晶型預(yù)測的效率更是驚人,僅用 14 天便能得到常規(guī)研究方法需要 1 年時間才能獲得的結(jié)果。

馬健表示,人工智能相當(dāng)于給藥物化學(xué)家插上了想象力的翅膀,比如要設(shè)計一個分子,構(gòu)造新的化合物,AI 其實起到了放大器的作用,給科學(xué)家提供新的工具,工具非常重要,工具決定生產(chǎn)力,也決定生產(chǎn)關(guān)系。藥物研發(fā)當(dāng)中的生產(chǎn)關(guān)系即是研發(fā)策略,AI 技術(shù)把一些瓶頸解決之后重組很多新的研發(fā)策略,能讓結(jié)果變得更加優(yōu)化。 而 AI 制藥未來下一個拼圖會是什么?他認為最重要的還是數(shù)據(jù)問題。AI 有數(shù)據(jù)和訓(xùn)練集,挖掘已有的數(shù)據(jù)很重要,但更重要的是提高產(chǎn)生數(shù)據(jù)的能力。

藥物的發(fā)現(xiàn)從最微觀的分子蛋白、到細胞、再到動物,整個過程就是一步一步建立生物和生命體相互認知的過程,AI 發(fā)揮的主要作用目前來講是在比較早期的階段,這個階段可以視作物理建模區(qū),這個尺度下很多的相互作用和要素比較簡單,可以通過大量精確的物理學(xué)模擬獲得虛擬數(shù)據(jù)。通過虛擬數(shù)據(jù)的訓(xùn)練,有針對性地提升 AI 的表現(xiàn)。 但是到了后面,更多要依賴于直接去探索自然界的實驗和人的經(jīng)驗,靠底層物理學(xué)的建模,不可能做好或較好完成這件事。因為,從分子到人是一條線,每一兩個點之間都有尺度的鴻溝,所以要思考在這個地方該用什么樣的方式來提升 AI 要表現(xiàn)的能力。

AI 藥物發(fā)現(xiàn)不是單純的算法問題,傳統(tǒng)上實驗工作更多基于過去人的腦力活動研究一種條件來進行,受限于實驗條件和物理規(guī)律,但是接下來科學(xué)家們需要更加豐富的實驗技術(shù),打造更加強大的 AI 大腦,為它提供豐富更多標(biāo)準(zhǔn)化和高通量的數(shù)據(jù)。 馬健最后總結(jié),AI 賦能藥物研發(fā)自動化、智能化是一個非常重要的建設(shè)工作,也是一個新的基建過程。過去這些年 AI 藥物研發(fā)公司,分布在從機理研究藥物設(shè)計乃至到臨床研究,現(xiàn)在正從局部優(yōu)化逐漸走向全局優(yōu)化,希望AI助力新藥研發(fā)帶來一個全新的加速過程。 晶泰科技在項目實踐中,已經(jīng)實現(xiàn) 1年左右將新藥研發(fā)項目推進至 PCC 階段,基本集成了以人工智能為核心的一站式藥物發(fā)現(xiàn)能力。晶型預(yù)測的效率更是突破性地提升,將項目研發(fā)周期縮短至14 天。在研究準(zhǔn)確度更高,結(jié)果更具理論依據(jù)的基礎(chǔ)上,晶泰科技的研發(fā)模式大幅提升藥物研發(fā)關(guān)鍵環(huán)節(jié)的效率。這些真實的項目數(shù)據(jù),展示出人工智能技術(shù)有望成為生命科學(xué)爆發(fā)與裂變的技術(shù)支點,創(chuàng)造出更好的“新藥神”。 -End-

原文標(biāo)題:晶泰科技CEO馬?。篈I正在成為生命科學(xué)爆發(fā)與裂變的技術(shù)支點

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