在精準醫療概念的推動下，同一疾病在不同個體間存在的差異，將會影響臨床醫師用藥準則的觀念已被多數大眾接受。而作為臨床研究重要工具的二代測序(next generation sequence,NGS)，因價格快速降低，已加速運用于臨床診斷。根據全球市場研究機構集邦咨詢預估，NGS設備全球市場規模在2017年估計達到50億美元，預計2025年可達約231億美元，2017-2025年復合成長率(CAGR)為21.1%。

目前全球NGS測序技術的發展，仍以英、美兩國為主要技術發展國家，美國以Illumina及Thermo Fisher Scientific兩強為主，英國則以Oxford Nanopore technologies(三代測序技術)為發展亮點。而中國大陸則以華大基因BGI領軍，除了已有自有品牌測序儀器問世外，也積極的布局測序服務市場，***地區也有體學生物科技著眼于三代測序技術的改良與研發。2018年初，Illumina Inc.與Thermo Fisher Scientific合作所推出的新機型iSeq100，試圖將測序價格進一步降低，且更加符合臨床應用場景的需求，此外，iSeq100的核心關鍵組件(CMOS感測芯片)，則由***地區芯片設計廠晶相光設計，且由力晶集團負責代工關鍵零組件，這是***地區首次打入全球NGS測序技術競爭的環節之中。

TrendForce生技產業分析師蔡尚磷指出，NGS技術具有高通量測序及高準確率兩項優勢，且NGS技術能將人體基因體的「模擬數據」轉換成可操作、應用及分析的「數字數據」供臨床研究人員應用；而數字化后的基因體數據便能與各臨床數據數據庫進行比對分析，便能夠在臨床上用來協助判斷病人身上病灶（如腫瘤組織）的基因突變情況（如：突變序列改變狀態），而可以在短時間內給予臨床醫師客觀信息，用以支持后續處置及用藥決策，進一步達到對每個病患采取不同處置及用藥的精準醫療。

自2016年起迄今，FDA核準一系列以NGS技術為基礎的體外診斷醫材上市許可，建立NGS技術在臨床應用發展IVD化的里程碑，同時也實現FDA落實基因診斷應用的承諾。2017年底，FDA核準Foundation Medicine的伴隨性診斷套組Foundation One CDx，作為實體腫瘤用藥的伴隨性診斷醫材，進一步確立NGS體外診斷應用的合法性。

NGS技術在臨床應用中的場域，除了在第三方檢測實驗室中執行之外，也有越來越多醫院的臨床檢驗實驗室，將NGS技術納入臨床檢測應用的工具之中。隨著臨床上NGS技術應用越來越廣，美國FDA醫療法規已明確規范基因測序應用的范疇，包含實驗室開發的檢測方法(Laboratory Developed Tests,LDTs)與體外檢測(In Vitro Diagnosis,IVD)等兩條明確的法規途徑。目前中國大陸及***地區對于NGS的法規監管態度與美國的觀點接近，實驗室自建檢測方法(LDTs)可用于合乎規范的臨床實驗室中，協助提供臨床醫療人員進行疾病診斷；而這一系列市場環境的明確與法規成熟，使得NGS技術的臨床應用將在未來幾年快速發展。

未來NGS測序應用市場發展，將著眼于臨床檢體分析處理及測序后基因體信息的應用兩大方向，其中嚴謹且符合臨床應用規范的生物信息及醫療信息的需求將大增，也因此協助NGS技術測序的前端檢體自動化處理平臺，以及符合質量標準規范的檢驗實驗室也將會是臨床上NGS技術應用的重要支持系統。