冷凍電鏡技術是解析生物大分子三維結構的關鍵手段,曾獲2017年諾貝爾化學獎,并在新冠病毒結構解析中發揮重要作用。然而,該技術的數據處理面臨圖像信噪比低、計算規模巨大、重構耗時長等挑戰,尤其在大規模原位結構解析中缺乏高效算法與軟件支持。
經過長期技術攻關,北京理工大學基于“DeepAI深算智能引擎+國產GPU加速卡”,成功研發具有自主知識產權的大規模冷凍電鏡圖像原位重構軟件——DisSPA,通過中科曙光提供的國產算力實現對冷凍電鏡圖像的高效、高精度原位結構解析,標志著我國在生物計算與結構生物學交叉領域取得重要突破。
項目團隊創新性提出并實現了基于國產GPU加速卡的并行化緩存方案與多卡GPU-FFT技術,顯著降低預處理時間與內存負載,解決了傳統方法中模板匹配效率低、存儲需求大等瓶頸。
在實際測試中,DisSPA在國產GPU單卡上相比CPU單核實現高達961.9倍的性能提升,相比32核CPU也有30.9倍性能提升。在處理400張大規模圖像數據時,僅需22分鐘即可完成重構,遠超傳統處理效率。
目前,DisSPA已完成在多家單位的應用示范,支持紅藻捕光系統、酵母核糖體等典型生物結構的原位解析,驗證了其在高精度結構解析中的可靠性與實用性,具備大規模對外服務能力。
未來,北京理工大學將與中科曙光持續推進DisSPA的推廣應用,開展系列培訓與學術交流,助力更多生物學家高效獲取高分辨率原位結構,推動我國在結構生物學與人工智能交叉領域的前沿發展。
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原文標題:北京理工大學 × 曙光AI,生物結構解析快近1000倍!
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