2022年合成生物學(xué)再次引爆話題。先是5月份中國(guó)發(fā)布《“十四五”生物經(jīng)濟(jì)發(fā)展規(guī)劃》,提及合成生物學(xué)是加快生物經(jīng)濟(jì)創(chuàng)新發(fā)展的國(guó)家戰(zhàn)略科技力量之一;再到9月份美國(guó)啟動(dòng)“國(guó)家生物技術(shù)和生物制造計(jì)劃”,宣布將斥資超20億美元加速合成生物學(xué)在內(nèi)的生物技術(shù)創(chuàng)新。能夠看出,合成生物學(xué)領(lǐng)域已成為大國(guó)競(jìng)爭(zhēng)的另一角力場(chǎng)。
目前,該領(lǐng)域仍主要處于布局發(fā)展?fàn)顟B(tài),產(chǎn)業(yè)生態(tài)尚未形成,這一形勢(shì)受到體制機(jī)制、制度環(huán)境、人才、資本、市場(chǎng)等方方面面的影響,當(dāng)然,還包括非常重要的技術(shù)問(wèn)題。從“可合成”到“可量產(chǎn)”,成果轉(zhuǎn)化需要跨越“達(dá)爾文之海”,而很多企業(yè)都折戟于此,就連鼎鼎大名的產(chǎn)業(yè)化先驅(qū)Amyris也曾在生物燃油的量產(chǎn)上面失過(guò)手。
不過(guò)也有企業(yè)能夠迅速突破這種技術(shù)瓶頸實(shí)現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化,國(guó)內(nèi)的態(tài)創(chuàng)生物就是其中之一。
稱態(tài)創(chuàng)生物為“黑馬”可能并不為過(guò),該公司成立于2021年,創(chuàng)立10個(gè)月內(nèi)就完成了過(guò)億美元融資。作為一家全產(chǎn)業(yè)鏈公司,在創(chuàng)始人張志乾的帶領(lǐng)下,態(tài)創(chuàng)生物已率先實(shí)現(xiàn)了小分子肽、赤蘚糖醇等30余種合成生物產(chǎn)品的落地量產(chǎn),且年產(chǎn)量超過(guò)萬(wàn)噸。
從實(shí)驗(yàn)室到產(chǎn)業(yè)化,從‘可合成’到‘可量產(chǎn)’,規(guī)模化的同時(shí)還要處理好工藝放大帶來(lái)的問(wèn)題,如菌群密度和產(chǎn)量的下降、分離純化以及染菌等難題。
“很多企業(yè)的處理手段集中在對(duì)生產(chǎn)條件的控制,而態(tài)創(chuàng)認(rèn)為,往往是源頭上的改造能夠起到非常關(guān)鍵的作用。”張志乾說(shuō)道。
張志乾是一名95后,博士就讀于中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)專業(yè),曾參加iGEM(國(guó)際基因工程機(jī)器大賽)獲得金獎(jiǎng)、最佳治療獎(jiǎng)等,還曾到耶魯大學(xué)訪學(xué)。
生物制造“量產(chǎn)”和“普適性”的雙向突破
面對(duì)成果轉(zhuǎn)化中的技術(shù)瓶頸,除了工藝層面的把控,態(tài)創(chuàng)生物還把著力點(diǎn)放在上游的元件調(diào)控上。公司應(yīng)用多種基因編輯工具、定向進(jìn)化及微流控平臺(tái)等技術(shù)沉淀出自有元件庫(kù),搭建了獨(dú)有的TidetronAltra平臺(tái)型菌株庫(kù)。
“通過(guò)元件的搭配來(lái)強(qiáng)化宿主菌株,使其增殖能力增強(qiáng),繁衍密度提高,從而獲得目標(biāo)產(chǎn)物的高產(chǎn)。”
他舉例道,“工藝放大后常規(guī)菌株的產(chǎn)率會(huì)下降為原來(lái)的1/5甚至是1/10,如果正常的基數(shù)是5或者10,那么態(tài)創(chuàng)生物則能夠做到20或者30。這樣的話,即使在放大過(guò)程中產(chǎn)率有所下降,仍然是一個(gè)非常可觀的數(shù)值。”
“態(tài)創(chuàng)生物之所以能夠做到這種水平,是源于長(zhǎng)期的積累和開發(fā)。”
“從早期研究開始,團(tuán)隊(duì)就以目標(biāo)為導(dǎo)向,更多地關(guān)注從‘可合成’到‘可量產(chǎn)’的工藝放大過(guò)程中,菌群如何變化,以及基因表達(dá)或沉默會(huì)造成怎樣的通路變化。對(duì)于不同的菌株和不同的目標(biāo)產(chǎn)物,條件往往也是不一樣的。”
“然后,態(tài)創(chuàng)生物對(duì)這些長(zhǎng)期積累的信息進(jìn)行‘模塊化’、‘經(jīng)驗(yàn)化’,轉(zhuǎn)而應(yīng)用于生產(chǎn)中。需要強(qiáng)調(diào)的是,這種策略并非僅適用于某一類宿主生物或某一種物質(zhì)的量產(chǎn)合成,而是具有通用性的。結(jié)果就是,工藝放大后的產(chǎn)率甚至要比單純可合成的過(guò)程中還要提高1~2倍,實(shí)現(xiàn)了生物制造‘量產(chǎn)’和‘普適性’的雙向突破。”
而態(tài)創(chuàng)生物能夠在短期內(nèi)快速實(shí)現(xiàn)這些突破,還必須要感謝背后的一個(gè)隱形功臣——微流控平臺(tái)。態(tài)創(chuàng)生物是行業(yè)內(nèi)率先開始布局微流控平臺(tái)體系的合成生物公司之一。
率先布局微流控技術(shù)平臺(tái),開展開放式合作
根據(jù)資料,態(tài)創(chuàng)生物的微流控平臺(tái)體系是與來(lái)自英國(guó)劍橋大學(xué)、南京工業(yè)大學(xué)、中山大學(xué)等名校的科研團(tuán)隊(duì)合作研發(fā)的。該平臺(tái)體系主要由生物傳感器模塊、等離子誘變模塊、微液滴制備模塊、微液滴注射模塊、微液滴分選模塊、單克隆挑取模塊、菌株自動(dòng)培養(yǎng)模塊和菌株自動(dòng)分析模塊等八大模塊組成。
在整個(gè)研發(fā)鏈條中,該平臺(tái)主要應(yīng)用于菌株篩選環(huán)節(jié),也是被稱為限速步驟的重要環(huán)節(jié)。

(來(lái)源:受訪者提供)
據(jù)張志乾介紹,研發(fā)過(guò)程中團(tuán)隊(duì)會(huì)使用多種主流基因編輯工具將目標(biāo)基因插入到底盤菌株中,并利用定向進(jìn)化引入隨機(jī)突變,構(gòu)建出盡可能多的工程菌樣本庫(kù)“Tsample”,細(xì)胞數(shù)量通常在101?-102?。接著從海量樣本庫(kù)中篩選出其中的有益突變即優(yōu)勢(shì)菌株。
借助態(tài)創(chuàng)生物的微流控平臺(tái),篩選通量可達(dá)10?/天,比傳統(tǒng)篩選方式10?-10?/天提速3-4個(gè)數(shù)量級(jí),使菌株篩選耗時(shí)從幾年縮短至幾個(gè)月。
張志乾還介紹了微流控平臺(tái)的兩個(gè)核心要素,分別是篩選通量和篩選標(biāo)準(zhǔn)。
先來(lái)說(shuō)為什么能夠達(dá)到10?/天的篩選通量。通過(guò)設(shè)計(jì),該平臺(tái)可以實(shí)現(xiàn)在10至100微米范圍內(nèi)的低維通道結(jié)構(gòu)中通過(guò)快速加工處理或控制微小流體來(lái)實(shí)現(xiàn)定向篩選過(guò)程,極大地提高了篩選效率。
再來(lái)說(shuō)一下篩選標(biāo)準(zhǔn)的重要性。微流控平臺(tái)本身是一種篩選工具,其篩選標(biāo)準(zhǔn)仍依賴于自主研發(fā)的生物傳感器體系,靈敏且高效的生物傳感器的性能將直接影響到篩選效果。“盡管大類上會(huì)有相似的地方,但每一種物質(zhì)所對(duì)應(yīng)的傳感器的方式都不太一樣。經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期的摸索,態(tài)創(chuàng)生物已經(jīng)建立起了一套生物傳感器的篩選模式和篩選標(biāo)簽。”
對(duì)于微流控平臺(tái)的繼續(xù)優(yōu)化,態(tài)創(chuàng)生物主要有兩個(gè)方向。方向一是微流控芯片的設(shè)計(jì),精準(zhǔn)搭建不同標(biāo)準(zhǔn)對(duì)應(yīng)的芯片模式;方向二是通用的篩選的生物傳感器的設(shè)計(jì),系統(tǒng)性的智能生物傳感系統(tǒng),能夠幫助行業(yè)是去高效篩選物質(zhì)。
張志乾還表示,基于微流控平臺(tái)將進(jìn)行其他的延展和應(yīng)用。他重點(diǎn)提及利用微流控設(shè)備篩選不同的物質(zhì)所積累的數(shù)據(jù),進(jìn)行深度機(jī)器學(xué)習(xí),不斷提高模型的優(yōu)化能力,再反向去優(yōu)化生物合成的過(guò)程,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)目標(biāo)產(chǎn)物的可控生產(chǎn)。
“我們已經(jīng)達(dá)到10?/天的篩選效率,能夠積累的數(shù)據(jù)量是十分龐大的,毋庸置疑,這一成果非常值得期待。”
“我相信態(tài)創(chuàng)生物微流控平臺(tái)的應(yīng)用將為行業(yè)帶來(lái)積極的影響,目前公司已經(jīng)與一些高校進(jìn)行合作,未來(lái)還將開展更多開放式的合作。不過(guò)這是需要長(zhǎng)期布局來(lái)實(shí)現(xiàn)的。”張志乾表示。
產(chǎn)品布局調(diào)整,戰(zhàn)略重心轉(zhuǎn)移
隨著商業(yè)化落地案例以及資金量的積累,態(tài)創(chuàng)生物整體的選品邏輯發(fā)生了戰(zhàn)略性的調(diào)整,全面向“醫(yī)”、“食”、“美”、“安”進(jìn)行覆蓋。“公司的理念是萬(wàn)物生長(zhǎng),希望基于合成生物這種綠色制造的方式,去生產(chǎn)人們生活中更有廣泛影響力的產(chǎn)品,例如大宗產(chǎn)品。”
“過(guò)去,從收入規(guī)模來(lái)看,化妝品原料占比達(dá)到一半以上,目前已調(diào)整至1/4左右。”
“公司在庫(kù)物質(zhì)大約有50種,涉及的領(lǐng)域除了最開始的美妝和食品飲料添加物質(zhì),還拓展到了家具清潔、生物醫(yī)藥(包括一些檢測(cè)試劑的上游原料的制造)和農(nóng)業(yè)的添加物質(zhì),并且已經(jīng)開始有了較大規(guī)模的產(chǎn)業(yè)化的落地。”
可以看到,產(chǎn)品布局調(diào)整后,態(tài)創(chuàng)生物仍然能夠快速實(shí)現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化。
對(duì)此,張志乾表示,其核心在于無(wú)論是農(nóng)業(yè)添加物質(zhì)還是醫(yī)療試劑檢測(cè)的原料,我們的產(chǎn)品在性質(zhì)、活性、保存以及成本方面都有非常大的優(yōu)勢(shì)。
除此之外,在既往的已經(jīng)比較成熟的領(lǐng)域里面,團(tuán)隊(duì)積累了商業(yè)化的能力和產(chǎn)品的客戶,對(duì)于新研發(fā)的產(chǎn)品的快速商業(yè)化有很大的推動(dòng)作用。
舉例來(lái)說(shuō),最開始在美妝領(lǐng)域我們只生產(chǎn)少數(shù)幾種原料,隨著客戶對(duì)產(chǎn)品認(rèn)可度的提高,后續(xù)又推出膠原蛋白、角鯊烯等產(chǎn)品后,在前面已建立的合作基礎(chǔ)上,新產(chǎn)品很快就獲得了客戶的認(rèn)可。再之后,我們又將產(chǎn)品線延伸至非美妝領(lǐng)域,比如可降解塑料等大宗材料,也能夠快速獲得認(rèn)可。這種商業(yè)化的效應(yīng)是逐漸地推廣開的。
最后,張志乾還透露,公司正在籌劃和啟動(dòng)一些創(chuàng)新性的合作模式,未來(lái)3年內(nèi),將會(huì)采取一些大的動(dòng)作。
審核編輯 :李倩
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