Nanodcal是一款基于非平衡態格林函數-密度泛函理論（NEGF - DFT）的第一性原理計算軟件，主要用于模擬器件材料中的非線性、非平衡的量子輸運過程，是目前國內擁有自主知識產權的基于第一性原理的輸運軟件。可預測材料的電流 - 電壓特性、電子透射幾率等眾多輸運性質。

迄今為止，Nanodcal 已成功應用于1維、2維、3維材料物性、分子電子器件、自旋電子器件、光電流器件、半導體電子器件設計等重要研究課題中，并將逐步推廣到更廣闊的電子輸運性質研究的領域。

5.7. CO/Pd(100)結構優化:

5.7.1 研究背景

晶格常數(Lattice Constant)是晶體物質的基本結構參數，它與原子間的結合能有直接的關系。晶格常數的變化反映了晶體內部的成分、受力狀態等的變化。晶格常數亦稱為點陣常數。晶體結構即晶體的微觀結構，是指晶體中實際質點（原子、離子或分子）的具體排列情況。而對晶體的結構進行弛豫（優化）往往是研究晶體性質的最基本的前提，一個結構（晶格參數，原子位置，對稱性等）是否準確、合理往往能夠決定我們是否能夠得到正確的結果，在本文中，我們向大家展示Pd(100)_CO的結構弛豫的過程。

5.7.2 Bulk Pd結構弛豫

5.7.2.1 模型搭建

(1)雙擊圖標“Device Studio”快捷方式”打開軟件；

(2)選擇Create a new Project→OK→ 文件名：Pd(100)_CO，保存類型：ProjectFiles(*.hpf)→保存即可；

(3)右擊Pd(100)_CO→New→Crystal，輸入如下坐標。并點擊Build，并命名為Pd；

建立Pd晶體結構界面圖

5.7.2.2 結構弛豫

(1)準備弛豫的輸入文件:Relax.input；基組文件:Pd_LDA_DZP?.nad.

Simulator→Nanodcal→Relax

(2)選中弛豫文件，右擊Run,根據自己的計算機選擇合適的核數，進行計算：

提交任務計算界面

(3)計算完成后，得到Atom_relaxed.xyz文件，可在此文件中檢查結構。

5.7.3 Pd(100)切面結構弛豫

5.7.3.1 模型搭建

右擊Pd(100)_CO→New→Crystal，輸入如下坐標。并點擊Build，并命名為Pd(100)；

5.7.3.2 結構弛豫

(1)準備弛豫的輸入文件：Relax.input；基組文件:Pd_LDA_DZP?.nad。Simulator→Nanodcal→Relax。

(2)選中弛豫文件，右擊Run,根據自己的計算機選擇合適的核數，進行計算，計算結束之后產生Atom_relaxed.xyz文件，用于弛豫后的結構檢查。

審核編輯：郭婷