資料介紹
各種研究結果不斷證明,人類各種常見疾病都屬于復雜疾病,是由多基因、多因素、遺傳和環境共同作用的結果。借助于高通量生物技術的飛速發展,生物學家建立起了蛋白交互網絡,如果借助復雜網絡研究的方法,從這些網絡中找出與疾病相關的蛋白質子網絡,將有助于我們更深入地了解生物體的運作機制。本文提出了一種基于貪婪算法的搜索方法,能夠自動地搜索整個網絡中的子網或模塊,并且能夠結合芯片數據同時進行T檢驗來判斷子網絡對疾病表型的區分能力。通過計算子網的P值,給出該蛋白質子網絡的統計顯著性值并進行區分能力排序。運行結果表明,本方法不但能夠用于發現已知的疾病蛋白,而且能夠對未知的蛋白進行預測,結合生物芯片技術,將會對疾病基因的研究提供有價值的信息。
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