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      電子發(fā)燒友網>電子資料下載>電子資料>乳腺癌-冠心病標志物的生物信息篩選技術

      乳腺癌-冠心病標志物的生物信息篩選技術

      2021-04-30 | rar | 5.38 MB | 次下載 | 免費

      資料介紹

      　　運用生物信息學方法篩選乳腺癌-冠心病標志物，為乳腺癌誘發(fā)的冠心病治療提供潛在的作用靶點。從基因表達數據庫（ gene expression omnibus，（EO）中下載乳腺癌和冠心病相關表達譜芯片數據，使用GEOR篩選差異表達基因，依據Ⅴen圖交集獲取差異共表達基因，通過 DAVID網站進行基因功能注釋（ gene ontology，GO）及京都基因與基因組百科全書（KyooEncyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）生物功能富集分析， STRING網站和 Cytoscape3.7.2軟件進行蛋白互作分析。GEPIA和 Kaplan- Meier plotter進行對乳腺癌患者hub基因mRNA表達水平和預后分析。結果表明：2個數據集篩選得到差異表達基因286個，基于在乳腺癌中mRNA顯著性表達水平篩選出45個基因。GO功能富集分析發(fā)現差異表達基因主要在泛素蛋白轉移酶活性、糖蛋白結合、泛素蛋白連接酶結合等生物學過程發(fā)揮作用。KFGG分析顯示差異基因主要參與縫隙連接、腎素分泌、5-羥色胺能突觸、谷氨酸能突觸、血管平滑肌收縮、血小板活化、癌細胞蛋白多糖等多條信號通路?；颚蠷NA表達水平和預后分析顯示NIN、 POSTN、MAPT、MYO6、 MAPIB、FBO31、KⅣ、PK3R1等8個與冠心病相關的hub基因參與乳腺癌的發(fā)生、發(fā)展過程。NIN、 POSTN、MAPT、MYO6、MAPB、FBXO31KI、PIK3R可作為檢測乳腺癌誘導冠心病的潛在標志物。

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