利用深度學習分析實現核磁共振圖像分割
人的心臟是一個驚人的機器,能不間斷地運作長達一個世紀。測量心臟功能的重要方法之一是計算其射血分數:心臟在舒張期充滿血液后,在收縮期射出血液的百分比。獲得這一指標的第一步,便依賴于心臟圖像的心室分割(描繪區域)。
作者在紐約進行InsightAI計劃(http://insightdata.ai/)期間,決定響應AI Open Network主持的研究呼吁,參與解決右心室精確分割挑戰(https://ai-on.org/projects/cardiac-mri-segmentation.html)。設法通過超過少于當前一個數量級的參數,來達到目前最佳的結果。下面簡要說明一下過程。
▍問題描述
研究呼吁:
開發能夠從心臟核磁共振成圖像(MRI)數據庫中,自動分割右心室的系統。到目前為止,右心室分割主要由經典的圖像處理方法處理,現代深度學習技術將有可能提供更可靠,全自動化的解決方案。
2016年,由Kaggle發起的左心室分割挑戰的三名獲獎者,都采用了深度學習的解決方案。相比較而言,右心室(RV)分割更具挑戰性,原因如下:
在腔內存在與心肌相似的信號強度;右心室是復雜的新月形,從基部到頂點一直變化;分割頂點圖像的切片十分困難;患者的心室內形態和信號強度差異相當大,特別是有病理改變的病例,等等。
不使用醫學術語,識別右心室困難的原因是:左心室是一個厚壁的圓柱型區域,而右心室是一個不規則形狀的物體,較薄的心室壁有時會與周圍的組織混在一起。下圖是MRI快照中手工繪制的右心室內壁和外壁(心內膜和心外膜)輪廓:
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